Masjid Agung Kota Sibolga memiliki 3 pintu gerbang, dengan Gerbang Utama berada di Jalan Ahmad Yani Kota Sibolga serta 2 pintu lainnya berada di Jalan S.Parman dan Jalan Diponegoro.
Masjid Agung Kota Sibolga berdampingan dengan Gedung DPRD Kota Sibolga, Gedung BAZIS Kota Sibolga dan dekat dengan SD Swasta Islamiyah Kota Sibolga